makerroot - sGRNA互补反序的实现方式

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sGRNA互补反序的实现方式

编辑时间: 2023-07-20 21:42:53
浏览量: 221
作者: 爱好者

所有标签: go
文章分类: go后端
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package pkg

var complementMap = map[byte]byte{
    'A': 'T',
    'T': 'A',
    'C': 'G',
    'G': 'C',
}

func Complement(sgRNA string) string {
    sgRNABytes := []byte(sgRNA)
    for i := 0; i < len(sgRNABytes); i++ {
        sgRNABytes[i] = complementMap[sgRNABytes[i]]
    }
    return string(sgRNABytes)
}

func Reverse(sgRNA string) string {
    sBytes := []byte(sgRNA)
    for i := 0; i < len(sBytes)/2; i++ {
        j := len(sBytes) - 1 - i
        sBytes[i], sBytes[j] = sBytes[j], sBytes[i]
    }
    return string(sBytes)
}

func ComplementReverse(sgRNA string) string {
    return Reverse(Complement(sgRNA))
}